京都で産出される天然仕上砥の成り立ちは今から2億5千万年前、太平洋赤道付近の深海底に1千年に1ミリメートルという気の遠くなるような時をかけて降り積もった火山灰や放散虫(海産プランクトンの一種)の遺骸などの堆積物が、地殻変動の圧力や花崗岩マグマの熱により変化し、海洋プレートの移動によって京都付近の地表まで運ばれてきたものとされています。
いわば悠久の時と地球のダイナミックな活動がもたらした宝物と言えるでしょう。

京都天然砥石の発祥は800年以上に遡るとされています。鎌倉時代の高尾の重要文化財・神護寺領絵図では「砥取峯」が図示され、又、日本における最も古い記録では奈良時代の正倉院文書（しょうそういんもんじょ）で青砥という記述が確認されています。

京都教育大学名誉教授　井本伸廣氏は「合砥は遠い深海底で誕生し水と火のはからいで創られた京の逸品」と、京都新聞丹波版「丹波山地の砥石から」（2013年3月4日）の記事中で述べられました。